學校前身是安慶衛生學校，辦學歷史可以追溯到1943成立的“安徽省省立立煌高級助產護士職業學校”，是安徽省最早開辦的公立醫學教育學校。2007年3月，獨立升格為安慶醫藥高等專科學校，填補了皖西南醫藥高等教育空白。

　　學校占地面積630畝，建筑面積14萬平方米，教學儀器設備值4千余萬元。現有教職醫護員工633人。其中，教授3人（二級教授1人），主任（中）醫師3人，副教授、副主任（中）醫師等副高級職稱77人，具有碩士及以上學位教師106人。省學科帶頭人1人、高職高專專業帶頭人5人、先進工作者1人、優秀教師4人、教學名師4人、教壇新秀8人，享受國務院政府特殊津貼1人、市政府特殊津貼2人。

　　現有臨床醫學系、藥學系、護理系以及公共基礎部以及直屬附屬醫院1所，非直屬附屬醫院3所，近200家校外實習實訓基地。開設臨床醫學、康復治療技術、醫學影像技術、醫學檢驗技術、公共衛生管理、藥學、中藥學、藥品生產技術、藥品質量與安全、藥品經營與管理、保健品開發與管理、護理、助產等13個普通專科專業，在校生8千余人。

　　醫藥護主干專業已全部獲批為省級特色專業或專業綜合改革試點專業。現有央財支持的提升專業服務產業發展能力專業2個、實訓基地2個，國家“十一五”重點專科1個，省級特色專業3個、綜合改革試點專業2個、示范實訓中心4個、教學團隊1個、精品資源共享課程5門、校企合作實踐教育基地1個、教學成果二等獎、三等獎各2項，省高等教育振興計劃項目5項，省中醫藥事業發展專項資金項目1個，市級科技成果獎1項。承擔省自然科學、人文社科類研究重大項目等教科研課題達30余項。校級精品課程18門，省級精品資源共享課程4門。發表論文110余篇。實用新型專利4項。

　　學校是教育部對口支援西部教育成員單位、中國傳統醫學聯合會副會長單位、全國衛生職業教育康復技術研究會副會長單位、全國衛生高等職業教育協會常務理事單位、全國醫藥職業教育聯盟成員單位，省藥學專業技術人員繼續教育基地，市“紅十字救護培訓基地”。是連續3屆的“全國文明單位”、中華全國總工會“模范職工之家”。

　　辦學73年來，學校堅持“科學定位，錯位發展，提升內涵，彰顯特色”的辦學理念，已累計培養了4萬余名應用型人才。