河海大學有3個校區，分別是校本部、常州校區、江寧校區。

河海大學是一所有百年辦學歷史，以水利為特色，工科為主，多學科協調發展的教育部直屬全國重點大學，是國家首批授權授予學士、碩士和博士學位，實施國家“211工程”重點建設、國家優勢學科創新平臺建設以及設立研究生院的高校，擁有水文水資源與水利工程科學國家重點實驗室和水資源高效利用與工程安全國家工程研究中心。

校本部

位置：江蘇省南京市寧海路街道南京市鼓樓區西康路1號

河海大學校本部位于南京市鼓樓區清涼山北麓，占地800余畝，校園環境優美，綠樹成蔭，花香四季，參天法桐夾道而立。學校先后榮獲全國部門綠化“三百佳”和江蘇省“花園式高校”、“園林式單位”稱號。多次獲得江蘇省文明單位、江蘇省黨建思想政治工作先進集體稱號

常州校區

位置：江蘇省常州市晉陵北路200號

1986年河海大學在江蘇省常州市設立分校，后改為校區。常州校區是河海大學具有較完整辦學功能的重要組成部分，是學校建設高水平特色研究型大學的重要支撐。校區地處江蘇省蘇錫常經濟高速發展地區，位于常州國家高新技術產業開發區，與常州市行政中心比鄰，占地436畝。

江寧校區

位置：江蘇省南京市江寧開發區佛城西路8號

河海大學江寧校區教學區位于南京市江寧開發區，占地面積863畝，學生生活區占地面積134畝，教職工住宅占地80畝，總面積1077畝。江寧校區臨近將軍山、秦淮新河，是南京新時期發展的前沿，并與東南大學、南京航空航天大學相鄰。