南京中醫藥大學有2個校區，分別是仙林和漢中門校區。

南京中醫藥大學始建于1954年，是全國建校最早的中醫藥高等院校之一。學校坐落于南京，擁有仙林和漢中門兩個校區。現有各類在校生近2萬名，設有基礎醫學院、第一臨床醫學院、第二臨床醫學院、藥學院、經貿管理學院、護理學院、外國語學院、信息技術學院、心理學院共9所直屬學院，26個本科專業，涉及醫、管、理、工、經、文等6個學科門類。

南京中醫藥大學校區及地址

仙林校區：南京仙林大學城仙林大道138號

漢中門校區：江蘇省南京鼓樓區漢中路282號

設有9所直屬學院，有各類在校生20000余名，24個本科專業，涉及醫、管、理、工、經、文等6個學科門類，初步形成了以中醫藥為主體、中西醫結合、多學科為支撐協調發展的辦學格局。擁有3個博士后科研流動站，25個博士點和44個碩士點。