北京中醫藥大學有3個校區，分別是分別為和平街校區、望京校區和良鄉校區。

北京中醫藥大學是一所以中醫藥學為主干學科的全國重點大學，始建于1956年，學校現有3個校區，分別為和平街校區、望京校區和良鄉校區，是唯一進入國家“211工程”建設的高等中醫藥院校，也是國家“985優勢學科創新平臺”建設高校，直屬教育部管理，由教育部、國家衛生和計劃生育委員會(原衛生部)、國家中醫藥管理局和北京市共建。

良鄉校區：北京市房山區陽光南大街與白楊東路交叉口東北角

和平東橋校區(西校區)北京市朝陽區北三環東路11號

占地約400畝，主攻專業包括臨床，管理，法學，英語，研究生，博士生，針灸推拿，毗鄰對外經濟貿易大學，北京化工大學和北京服裝學院等高校。

望京校區(東校區)：北京市朝陽區中環南路6號

主要為中藥學院、護理學院和國際學院，有中藥實驗室、護理樓、國際學院樓。此外有學生公寓，小花園，國際學院預科，毗鄰中央美術學院，北京青年政治學院和中國社會科學院研究生院等院校。

截至2017年3月，設有中醫學院、中藥學院、生命科學學院、針灸推拿學院、管理學院、護理學院、人文學院、馬克思主義學院、國學院、國際學院、臺港澳中醫學部、第一臨床醫學院、第二臨床醫學院、第三臨床醫學院、第四臨床醫學院、第五臨床醫學院、第七臨床醫學院、研究生院、遠程教育學院、繼續教育學院、體育教學部等教學機構。設有中醫學、中藥學、中藥制藥、藥學、針灸推拿學、康復治療學、公共事業管理(衛生事業)、藥事管理、信息管理與信息系統、護理學、英語、法學(醫藥衛生)12個本科專業。