國家品牌專業12個：飛行器設計與工程、探測制導與控制技術、焊接技術與工程、輪機工程、飛行器動力工程、數學與應用數學、工商管理、建筑環境與能源應用工程、道路橋梁與渡河工程、化學工程與工藝、廣播電視編導、船舶與海洋工程。
國家重點專業9個：機械設計制造及其自動化、通信工程、材料科學與工程、測控技術與儀器、電氣工程及其自動化、土木工程、環境工程、建筑學、軟件工程。

哈爾濱工業大學特色專業:
航天:
哈工大的航天技術在全國那可是赫赫有名呀，我國第一艘航天載人飛船“神舟一號”就是由哈工大師生參與設計的，凝聚了哈工大師生無數的辛勤汗水，哈工大也是為之出力最多的高校，由于對載人航天技術的杰出貢獻，哈工大獲得了全國唯一的“載人航天協作獎”。哈工大下屬的“哈爾濱工大集團”已成為中國航天三大集團之一，而且學校也不斷地加強與國際一流機構的密切合作，成為國際宇航大學(ISU)在亞洲唯一常設分校的依托單位。
焊接:
可是哈工大的金字招牌啊，作為材料工程的重要組成部分，半個世紀以來，一直穩坐全國乃至全亞洲第一把交椅，哈工大的焊接大師們已經把有點“土”的焊工活發展成為服務國防尖端和現代工業的高科技學科。
飛行器設計和制造:
絕對是哈工大的王牌明星專業，但是要注意的是它們屬于不同的院系，飛行器設計工程專業屬于航天學院，而飛行器制造工程屬于機電工程學院，它們的區別主要在于：飛行器設計是進行飛行器結構、框架設計的，運用到很多力學原理，更側重于理論方面，而飛行器制造則是把這些設計應用計算和信息通信等輔助手段真正的制造成產品，它更強調實踐，所以學生可以根據自己的興趣來選擇自己合適的專業。
機械電子工程:
機械工程學科是我國最早建立的機械工程一級學科之一，在全國排名第一，已形成一批穩定而有特色并且處于國內高校領先地位或先進水平的研究方向：如機器人理論與技術、超精密加工與納米加工、特種制造、自動化與數字化制造等。該學科是一門學科高度交叉的技術領域，涵蓋了電子、機械、材料、化工、物理等專業。
計算機科學與技術:
創建于1956年，是中國最早的計算機專業之一。我國第一臺能說話會下棋的計算機、第一套漢字輸入法(即現在的微軟拼音輸入法)等都是在這里誕生的。而作為神舟飛船“大腦”的星載計算機也是由哈工大的師生以超常的速度高質量地完成的，可見其實力之雄厚啊!
土木工程:
哈爾濱工業大學的強項，在全國始終位于三甲的地位，它聞名全國還有另外一個原因，那就是許多著名的建筑設計都是由哈工大的土木工程的教師參與完成的，如1990年北京亞運會主場館和2008年奧運會主場館“鳥巢”方案的修改等，都顯示出了哈工大土木工程方面的非凡實力。