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吉林醫藥學院始建于1952年，前身為中國人民解放軍第四軍醫大學吉林軍醫學院，被譽為“白衣戰士的搖籃”。2004年8月，經國務院、中央軍委批準，學校由軍隊整體移交吉林省，定名為吉林醫藥學院，成為省屬公辦高等學校，是吉林省惟一獨立設置的西醫本科院校。

截至2013年5月，學校位于吉林省吉林市。占地面積52.60萬平方米，建筑面積26.60萬平方米。固定資產總值7.90億元，教學、科研儀器設備總值7315.51萬元。所有教室配有現代化的多媒體教學設備。圖書館館藏圖書124.20萬冊，紙質現刊1337種，中外文數據庫20種。文體活動中心建筑面積0.5萬平方米，內設射擊場、羽毛球場和籃球場。體育綜合運動場占地面積5.16萬平方米，設有塑膠田徑場、足球場、籃球場、排球場、網球場和室內健身館。校園網主干網千兆帶寬，各類信息點近萬個，實現了教學、辦公網絡化。

學校下設有9個教學院、系，3個直屬單位和附屬醫院6所，擁有各類實踐教學基地113家。設有17個本科專業及專業方向，6個專科專業，涵蓋醫、理、工、管4個學科門類。有專任教師568人，面向全國招生，有全日制在校生近9000人