上海海事大學現在有5個校區，分別為：臨港校區、民生路校區、東明路校區、港灣校區和海華學院校區

中國高等航海教育發軔于上海，2009年學校舉行百年校慶系列活動。上海海事大學是一所以航運、物流、海洋為特色，具有工學、管理學、經濟學、法學、文學和理學等學科門類的多科性大學。2008年，上海市人民政府與交通運輸部簽訂協議，共建上海海事大學。

1.上海海事大學臨港校區

地址：上海海事大學臨港校區。上海海事大學現有臨港校區、民生路校區、東明路校區、港灣校區、海華學院校區等5個校區。其中，臨港校區是目前學校辦學主體所在地，于2008年10月基本建成，校園占地面積133萬余平方米，總建筑面積60萬平方米;民生路校區是1959年上海海運學院成立之地;東明路校區是學校MBA、EMBA、高級航運學院(籌)辦學所在地;港灣校區、海華學院校區是學校高等、中等職業教育主要辦學地

2.上海海事大學民生路校區

地址：浦東新區。中國高等航海教育發軔于上海，1909年晚清郵傳部上海高等實業學堂(南洋公學)船政科開創了我國高等航海教育的先河。1912年成立吳淞商船學校，1933年更名為吳淞商船專科學校。1959年交通部在滬組建上海海運學院。

3.上海海事大學東明路校區

地址：上海市浦東新區東明路1338號。上海海事大學是一所以航運、物流、海洋為特色，具有工學、管理學、經濟學、法學、文學、理學和藝術學等學科門類的多科性大學。2008年，上海市人民政府與交通運輸部簽訂協議，共建上海海事大學。

4.上海理工大學港灣校區

地址：浦東大道2600號。學校設有2個博士后科研流動站(交通運輸工程、電氣工程)，2個一級學科博士點(交通運輸工程、管理科學工程)，19個二級學科博士點，13個一級學科碩士學位授權點，59個二級學科碩士學位授權點，6個專業學位碩士授權點，10個工程碩士點，47個本科專業。擁有11個省部級重點研究基地。

5.上海海事大學海華學院校區

地址：金橋路555號。校2013年成立中國(上海)自貿區供應鏈研究院和上海高級國際航運學院。中國(上海)自貿區供應鏈研究院將自貿區建設與供應鏈研究有機結合，以提升自貿區產業鏈建設水平，促進自貿區貨物貿易向服務貿易的轉型發展，同時推動政府監管職能的轉變。