上海中醫藥大學現在有2個校區，分別為：浦東新區和徐匯區

創立于1956年的上海中醫藥大學，是新中國誕生后國家首批建立的四所中醫藥高等院校之一，也是上海市屬高校中唯一的一所醫科類重點特色院校。學校位于浦東新區張江高科技園區科研教育區內，占地500余畝，教學設施齊全、環境優美，在上海建設“創新型城市”戰略布局中，已成為“張江藥谷”的重要組成部分。

1.上海中醫藥大學浦東新區

地址：蔡倫路1200號中醫藥大學內(近華佗路)。創立于1956年的上海中醫藥大學，是新中國誕生后國家首批建立的四所中醫藥高等院校之一，也是上海市屬高校中唯一的一所醫科類重點特色院校。1985年上海市中醫藥研究院成立，目前與上海中醫藥大學實行兩塊牌子、一套管理機構，學校校級領導兼任研究院院級領導的管理體制。學校位于浦東新區張江高科技園區科研教育區內，占地500余畝，教學設施齊全、環境優美，在上海建設“創新型城市”戰略布局中，已成為“張江藥谷”的重要組成部分。

2.上海中醫藥大學徐匯區

地址：零陵路530號15號樓5層。建校60年來，為國家培養和輸送了各級各類中醫藥專門人才，校友遍布60多個國家和地區。學校擁有700多名專家和教授，3名兩院院士，76名全國老中醫藥專家學術經驗繼承班指導老師，64名上海市名中醫。1999年，我校首批通過了教育部“本科教學工作優秀學校”的評估，并于2007年再次被評為“優秀”。綜合實力位居全國中醫院校前列。